Web 服务
Cryosparc
CryoSPARC 是一个用于单颗粒电子显微镜 (cryo-EM) 数据处理和三维重建的软件平台。它专为高效地处理低温电子显微镜产生的大量数据而设计，被广泛应用于结构生物学研究中，用于揭示蛋白质复合物、病毒和其他生物大分子的详细三维结构。
NextPYP
NextPYP 是由杜克大学的 Bartesaghi 实验室开发和维护的一个综合性平台，用于单颗粒冷冻电子显微镜（cryo-EM）和断层扫描（ET）图像分析。NextPYP 因其全面的功能和易用性，被广泛用于结构生物学领域的单颗粒分析。
易于使用的网络界面： NextPYP 提供了一个便携且功能齐全的基于网络的图形用户界面，使用户能够方便地进行操作。
实时数据预处理： 能够实时进行单颗粒和断层扫描数据的预处理，提高数据分析的效率。
高分辨率结构解析的端到端工作流程： 支持从数据导入到高分辨率结构解析的全流程处理，适用于单颗粒和断层扫描数据。
2D/3D粒子选择： 采用基于尺寸、几何和神经网络的方法进行粒子选择和分析。
扩展性与存储优化： 实现可扩展性，同时优化存储需求，无需保存完整大小的断层图、子体积或粒子堆栈。
多模式限制性精炼和分类： 针对异质性分析提供多模式的限制性精炼和分类功能。
基于粒子的 CTF 精炼和电影帧精炼： 包括基于粒子的CTF（对比度传递函数）精炼、电影帧精炼以及自适应曝光权重调整。
元数据导入/导出： 支持 .star 格式元数据的导入和导出，以便与外部程序进行接口连接。
NIDVD AI 论文图片查重系统
ComfyUI
ComfyUI 是一个基于节点的图形用户界面，用于操作 Stable Diffusion 模型。它允许用户通过链接不同的节点来构建复杂的图像生成工作流。ComfyUI 提供了一种直观的方式来创建和定制 AI 图像生成过程，无需编写代码。其特性包括支持多种模型，异步队列系统，以及高级的内存管理功能，使其在低至 1GB 显存的 GPU 上也能运行。此外，ComfyUI 支持在没有 GPU 的情况下进行操作，不过这会较慢。它还提供了丰富的插件支持，用户可以根据需要进行功能扩展和自定义设置。
Deepseek@Local On Dify
Dify 是一个开源的 LLM 应用开发平台，帮助用户从原型快速到达生产阶段。它通过直观的界面结合代理式 AI 工作流、RAG 管道、代理功能、模型管理和可观测性功能，使得构建和管理强大的 AI 应用程序变得简单。以下是 Dify 的核心功能介绍：
关键功能
工作流：在视觉画布上构建和测试强大的 AI 工作流，利用所有以下功能甚至更多。
综合模型支持：与数百种专有或开源的 LLMs 无缝集成，包括来自数十个推理提供商和自托管解决方案的 GPT、Mistral、Llama3，以及任何兼容 OpenAI API 的模型。支持的模型提供商完整列表请查看相关文档。
Prompt IDE：为编写提示词提供直观界面，可以比较模型性能，并为基于聊天的应用程序添加如文本转语音等额外功能。
RAG 管道：具备从文档摄取到检索的广泛 RAG 能力，开箱即用支持从 PDF、PPT 及其他常见文档格式中提取文本。
代理功能：基于 LLM Function Calling 或 ReAct 定义代理，并为代理添加预构建或自定义工具。Dify 为 AI 代理提供了 50 多种内置工具，例如 Google 搜索、DALL·E、Stable Diffusion 和 WolframAlpha。
LLMOps：通过监控和分析应用程序日志和性能，基于生产数据和注释持续改进提示词、数据集和模型。
后端即服务：Dify 的所有服务都提供相应的 API，您可以轻松地将 Dify 集成到自己的业务逻辑中。
GROBID Api 服务
GROBID 是一个机器学习库，用于从原始文档（如PDF）中提取、解析和重新结构化内容，并将其转换为结构化的XML/TEI编码文档，尤其专注于技术和科学出版物。GROBID 是一个在科学文献前处理领域具有较高水平的工具，尤其在从PDF文档中提取和结构化信息方面表现出色。GROBID 提供了从科学文献中提取多种类型信息的功能，包括：
头部信息提取（标题、作者、摘要、关键词等）。
参考文献提取与解析（支持DOI、PMID等元数据）。
全文结构化（段落、章节、图表、脚注等）。
引用上下文识别与解析。
专利和非专利参考文献提取。
资助信息提取与匹配。