IQ-TREE
集群已配置 IQ-TREE 的稳定版本(v1.6.12)和COVID-19版本(v2.1.3), 使用 module environment 载入环境使用:
module load iqtree/1.6.12
iqtree -h
module load iqtree/2.1.3
iqtree2 -h
建树需要占用较多计算资源,请勿直接在管理节点下运行高负荷计算, 应提交任务至计算节点,脚本示例:
#!/bin/bash
#
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -l walltime=240:00:00
#PBS -N iqtree
#PBS -q avx
#PBS -j oe
module load iqtree/2.1.3
cd $PBS_O_WORKDIR
iqtree2 -s example.phy