MotionCor2

MotionCor2程序存放于/share/apps/MotionCor2,最新版本为1.4.4,支持cuda<11.4, 指定路径即可使用,运行需要CUFFT和LibTIFF,请根据版本加载cuda。

使用手册 MotionCor2 UserManual 08-11-2021

  • 收录版本

    MotionCor2_1.2.3-Cuda80
    MotionCor2_1.2.6-Cuda80
    MotionCor2_1.2.6-Cuda101
    MotionCor2_1.4.0_Cuda101
    MotionCor2_1.4.4_Cuda102-08-11-2021
    MotionCor2_1.4.4_Cuda112-08-11-2021

PBS Example

#PBS -l nodes=c007:ppn=16
#PBS -l walltime=120:00:00
#PBS -q x3650k40
#PBS -j oe
#PBS -N motioncor2
#PBS -n

cd $PBS_O_WORKDIR
module load MotionCor2

MotionCor2_1.4.4_Cuda112-08-11-2021 -InMrc /hp/20181011_CVB1_9A3/Images-Disc1/mrc/ \
-OutMrc /data/em/yuhai/corr_ -Throw 1 -Serial 1