TopNetTree

载入TopNetTree运行环境,包括matlab R2016b, R-4.1.2, tensorflow-1.0.1 on python/2.7.12:

ssh amax01
module load TopNetTree/1.0

创建目录解压TopNetTree脚本及训练模型,修改所有脚本为可执行:

mkdir TopNetTree
cp /data/apps/TopNetTree/1.0/TopNetTree_v1.0.zip TopNetTree/
cd TopNetTree
unzip TopNetTree_v1.0.zip
chmod u+x code data

运行示例:

cd code
cp example_structure/1AK4.pdb .
./run_topnettree.sh 1AK4.pdb D A G 488 0